Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOR4AQ9NXH8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms