Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms