Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLE1Q9NVX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms