Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PARVAQ9NVD7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms