Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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