Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms