Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTG1Q9NSN8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms