Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMSN1Q9NSI8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms