Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO8Q9NRD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms