Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEPEQ9NQ76 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEPEQ9NQ76 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms