Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms