Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms