Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00472Q9H8W2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms