Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms