Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms