Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB1BQ9H0U4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms