Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C20orf27Q9GZN8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms