Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms