Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS2Q9BVG9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms