Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KATNB1Q9BVA0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms