Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM42Q9BTD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms