Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms