Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MGME1Q9BQP7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms