Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USB1Q9BQ65 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms