Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms