Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD1Q99460 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms