Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms