Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms