Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SAMD8Q96LT4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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