Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms