Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD1Q96GM5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms