Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC51Q96ER9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC51Q96ER9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms