Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms