Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NXNL1Q96CM4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NXNL1Q96CM4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms