Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF428Q96B54 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms