Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYAP1Q96A49 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYAP1Q96A49 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms