Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms