Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRUQ92729 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms