Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms