Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms