Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF397Q8NF99 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms