Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE23Q8NDY6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms