Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms