Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms