Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms