Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CHCHD4Q8N4Q1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CHCHD4Q8N4Q1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CHCHD4Q8N4Q1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CHCHD4Q8N4Q1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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