Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD35Q8N283 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD35Q8N283 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms