Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMB4Q86W47 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMB4Q86W47 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms