Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLNKQ7Z7G1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLNKQ7Z7G1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms