Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms